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Universität Erlangen-Nürnberg

Master of Science Informatik

Prof. Dr.

2024

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Einführung in die Bioinformatik für die Translationale Medizin - Cheatsheet
Einführung in die Bioinformatik für die Translationale Medizin - Cheatsheet Definition und Geschichte der Bioinformatik Definition: Bioinformatik: Anwendung von Informatikmethoden zur Analyse biologischer Daten. Ursprünge in den 1960er Jahren aufgrund der Notwendigkeit, molekularbiologische Daten effizient zu verarbeiten. Details: 1960er: Erste Auswertungen von DNA/RNA-Sequenzen. 1970er: Entwicklu...

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Einführung in die Bioinformatik für die Translationale Medizin - Exam
Einführung in die Bioinformatik für die Translationale Medizin - Exam Aufgabe 1) Die Bioinformatik hat sich seit den 1960er Jahren durch die Anwendung von Informatikmethoden zur Analyse biologischer Daten enorm weiterentwickelt. Sie begann mit der Notwendigkeit, DNA- und RNA-Sequenzen effizient zu verarbeiten, gewann in den 1980er Jahren mit dem Human Genome Project und der Entwicklung von Datenba...

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Was ist Bioinformatik?

Wann begann die Bioinformatik und warum?

Welche Entwicklungen prägten die Bioinformatik in den 1980er Jahren?

Was ist Paarweiser Alignment in der Bioinformatik?

Welche Algorithmen werden für Multiple Sequence Alignment verwendet?

Welche Bewertungsmethoden werden bei Sequenzalignments verwendet?

Was versteht man unter Röntgenkristallographie?

Welche Methode analysiert die magnetischen Eigenschaften von Atomkernen?

Welche Anwendung haben Röntgenkristallographie und NMR-Spektroskopie in der Medizin?

Was sind typische Machine Learning-Methoden in der Medizin?

Welche Datenquellen werden in der Medizin für Machine Learning verwendet?

Welche Herausforderungen gibt es beim Einsatz von Machine Learning in der Medizin?

Was versteht man unter personalisierter Medizin?

Was ist das Ziel der Genomsequenzierung?

Welches ist eine der Herausforderungen der personalisierten Medizin?

Welche Algorithmen werden für das Sequenzalignment in der Bioinformatik verwendet?

Was ist das Hauptziel der Algorithmen Needleman-Wunsch und Smith-Waterman?

Welche Komplexität haben die Algorithmen Needleman-Wunsch und Smith-Waterman?

Was ist Homologie-Modellierung?

Welcher Schritt ist NICHT Teil der Homologie-Modellierung?

Was ist ein Vorteil der Ab initio Methoden?

Was versteht man unter Genomics?

Welche klinischen Anwendungen haben Omics-Technologien?

Welche Werkzeuge werden zur Analyse in Omics-Technologien verwendet?

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Diese Konzepte musst du verstehen, um Einführung in die Bioinformatik für die Translationale Medizin an der Universität Erlangen-Nürnberg zu meistern:

01
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Grundlagen der Bioinformatik

Dieser Abschnitt behandelt die fundamentalen Konzepte und Prinzipien der Bioinformatik, die die Grundlage für das gesamte Gebiet bilden.

  • Definition und Geschichte der Bioinformatik
  • Zentrale Techniken und Werkzeuge
  • Datenarten und Datenspeicherung
  • Konzepte des Sequenzierens und der Sequenzanalyse
  • Bioinformatische Methoden zur Genom-Annotation
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Sequenzanalyse

Diese Einheit konzentriert sich auf die Analyse von DNA-, RNA- und Proteinsequenzen, einschließlich der verwendeten Algorithmen und Technologien.

  • Alignments: Pairwise und Multiple Sequence Alignments
  • Algorithmen wie Needleman-Wunsch und Smith-Waterman
  • Datenbankabfragen z.B. BLAST
  • Phylogenetische Analysen und Stammbäume
  • Sekundärstrukturanalyse von RNA
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03
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Strukturanalyse

Hier werden die Methoden zur Analyse von biologischen Molekülstrukturen behandelt, einschließlich der Techniken zur Vorhersage und Modellierung.

  • 3D-Strukturbestimmung mittels Röntgenkristallographie und NMR
  • Homologie-Modellierung und Ab initio Methoden
  • Molekulardynamik-Simulationen
  • Visualisierung und Analyse von Proteinstrukturen
  • Docking-Studien für die Wirkstofffindung
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04
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Datenbanken und Algorithmen in der Medizin

Diese Einheit untersucht spezialisierte Datenbanken und Algorithmen, die in der medizinischen Informatik verwendet werden.

  • Struktur und Funktion biologischer Datenbanken
  • Relevante medizinische Datenbanken z.B. GenBank, PDB
  • Algorithmen zur Datenbankabfrage und Datenintegration
  • Machine Learning-Methoden in der Medizin
  • Sicherheit und Datenschutz in medizinischen Datenbanken
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Anwendungen in der translationalen Medizin

Diese Sektion zeigt auf, wie bioinformatische Methoden in der translationalen Medizin angewendet werden, um Forschung in klinische Praxis umzusetzen.

  • Omics-Technologien und ihre klinischen Anwendungen
  • Personalisierte Medizin und Genomsequenzierung
  • Biomarker-Entdeckung und Validierung
  • Computergestützte Diagnostik und Therapie
  • Integration von Multi-Omics-Daten zur Krankheitsforschung
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Alles Wichtige zu diesem Kurs an der Universität Erlangen-Nürnberg

Einführung in die Bioinformatik für die Translationale Medizin an Universität Erlangen-Nürnberg - Überblick

In der Vorlesung 'Einführung in die Bioinformatik für die Translationale Medizin' an der Universität Erlangen-Nürnberg erhältst Du einen umfassenden Einblick in die grundlegenden Konzepte und Anwendungen der Bioinformatik im Bereich der translationalen Medizin. Der Kurs richtet sich vor allem an Studierende der Informatik und kombiniert intensive Theorieeinheiten mit praktischen Übungen. Pro Woche wirst Du etwa 4 Stunden in den Kurs investieren müssen. Am Ende des Semesters wird Dein Wissen in einer schriftlichen Prüfung getestet. Der Kurs wird in der Regel im Wintersemester angeboten.

Wichtige Informationen zur Kursorganisation

Kursleiter: Prof. Dr.

Modulstruktur: Die Vorlesung besteht aus intensiven Theorieeinheiten und praktischen Übungen. Der Zeitaufwand beträgt etwa 4 Stunden pro Woche.

Studienleistungen: Die Leistungskontrollen erfolgen durch eine schriftliche Prüfung am Ende des Semesters.

Angebotstermine: Der Kurs wird üblicherweise im Wintersemester angeboten.

Curriculum-Highlights: Grundlagen der Bioinformatik, Sequenzanalyse, Strukturanalyse, Datenbanken und Algorithmen in der Medizin, Anwendungen in der translationalen Medizin

So bereitest Du Dich optimal auf die Prüfung vor

Beginne frühzeitig mit dem Lernen, idealerweise schon zu Beginn des Semesters, um Dir die nötige theoretische Basis anzueignen.

Nutze verschiedene Ressourcen, wie Bücher, Übungsaufgaben, Karteikarten und Probeklausuren, um dein Wissen zu vertiefen.

Schließe Dich Lerngruppen an und tausche Dich mit anderen Studierenden aus, um gemeinsam Lösungsstrategien zu entwickeln.

Vergiss nicht, regelmäßige Pausen einzulegen und in diesen Zeiten komplett abzuschalten, um eine Überbelastung zu vermeiden.

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