Alle Lernmaterialien für deinen Kurs Maschinelles Lernen in der klinischen Bioinformatik

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Universität Erlangen-Nürnberg

Master of Science Informatik

Prof. Dr.

2024

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Maschinelles Lernen in der klinischen Bioinformatik - Cheatsheet
Maschinelles Lernen in der klinischen Bioinformatik - Cheatsheet Beaufsichtigtes und unbeaufsichtigtes Lernen Definition: Beaufsichtigtes und unbeaufsichtigtes Lernen: Grundlegende Methoden des maschinellen Lernens, verwendet in verschiedenen Anwendungen der klinischen Bioinformatik. Details: Beaufsichtigtes Lernen: Training mit gelabelten Daten Ziel: Zuordnung von Eingaben zu bekannten Ausgaben B...

Maschinelles Lernen in der klinischen Bioinformatik - Cheatsheet

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Maschinelles Lernen in der klinischen Bioinformatik - Exam
Maschinelles Lernen in der klinischen Bioinformatik - Exam Aufgabe 1) In der klinischen Bioinformatik können sowohl beaufsichtigte als auch unbeaufsichtigte Lernverfahren verwendet werden, um aus den biomedizinischen Daten wertvolle Erkenntnisse zu gewinnen. Angenommen, du arbeitest an einem Projekt, um bioinformatische Daten zu analysieren, die zur Vorhersage bestimmter Krankheitszustände verwend...

Maschinelles Lernen in der klinischen Bioinformatik - Exam

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Was ist beaufsichtigtes Lernen im Kontext des maschinellen Lernens?

Nenne ein Verfahren des unbeaufsichtigten Lernens.

Was ist das Ziel des unbeaufsichtigten Lernens?

Was ist die Validierung in der Bioinformatik?

Welche Methode wird zur besseren Schätzung der Modellleistung verwendet?

Welche Metrik wird NICHT zur Bewertung von ML-Modellen verwendet?

Was ist der Prozess des Anlernens eines neuronalen Netzes, um genaue Vorhersagen zu machen, durch Anpassung der Netzwerkgewichte?

Welche Techniken können verwendet werden, um Overfitting bei Deep Learning Modellen zu verhindern?

Welche Evaluierungsmetriken sind üblich zur Beurteilung der Leistung von Deep Learning Modellen?

Was ist der Zweck der Integration verschiedener Datentypen zur Krankheitsvorhersage?

Welche Methoden werden für die Datenfusion eingesetzt?

Welche Algorithmen werden für maschinelles Lernen verwendet?

Was ist Feature-Engineering?

Welche Techniken werden bei der Datenvorverarbeitung verwendet?

Welche Transformationstechniken gibt es?

Was ist die Definition von Regression und Überlebenszeitanalysen?

Welche Formel beschreibt die Logistische Regression?

Was ist der Zweck des Kaplan-Meier-Schätzers?

Was ist die Definition der Identifikation von Biomarkern durch ML?

Welche Datenquellen werden häufig für die Identifikation von Biomarkern verwendet?

Welche Feature-Selection-Methoden werden typischerweise bei der Identifikation von Biomarkern verwendet?

Was sind Fully Connected Networks (FCN) in der Deep Learning Architektur?

Was ist die Hauptaufgabe von Convolutional Neural Networks (CNN)?

Welche Architektur ist besonders effektiv in NLP-Anwendungen?

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Diese Konzepte musst du verstehen, um Maschinelles Lernen in der klinischen Bioinformatik an der Universität Erlangen-Nürnberg zu meistern:

01
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Überblick über Maschinelles Lernen

Einführung in die grundlegenden Konzepte und Methoden des maschinellen Lernens, inklusive unterschiedlicher Lernparadigmen und Anwendungsbeispiele.

  • Beaufsichtigtes und unbeaufsichtigtes Lernen
  • Klassifikations- und Regressionsmodelle
  • Evaluierung von Modellen und Performanzmetriken
  • Feature-Engineering und Datenvorverarbeitung
  • Einführung in gängige ML-Bibliotheken und Frameworks
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Anwendung von Machine Learning-Algorithmen in der Bioinformatik

Erforschung der spezifischen Anwendung von ML-Algorithmen zur Lösung von Problemen in der Bioinformatik, insbesondere in der klinischen Forschung.

  • Vorhersage und Klassifikation genetischer Daten
  • Analyse biologischer Sequenzdaten
  • Identifikation von Biomarkern durch ML
  • Integration von verschiedenen Datentypen zur Krankheitsvorhersage
  • Validierung und Replikation von ML-Modellen in der Bioinformatik
Karteikarten generieren
03
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Klinische Studien und deren Auswertung

Grundlage klinischer Studien und deren methodische Herausforderungen, sowie Einsatz von ML zur Datenanalyse und -interpretation von Studienergebnissen.

  • Design und Methoden klinischer Studien
  • Statistische Tests und Konfidenzintervalle
  • Regression und Überlebenszeitanalysen
  • Bias und Confounding in klinischen Studien
  • Machine Learning zur Auswertung klinischer Daten
Karteikarten generieren
04
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Neuronale Netze und Deep Learning

Vertiefung in neuronale Netzwerke und deren Variationen, mit Fokus auf Deep Learning Techniken und Anwendungen in der Bioinformatik.

  • Grundlagen von Neuronalen Netzwerken
  • Architekturen von Deep Learning Modellen
  • Techniken des überwachtes und unbeaufsichtigtes Lernen in Deep Learning
  • Training und Optimierung von Deep Learning Modellen
  • Anwendung von CNNs und RNNs in der Bioinformatik
Karteikarten generieren
05
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Genomik und Proteomik

Erforschung genetischer und proteomischer Daten mittels maschineller Lerntechniken, um Einsichten in biologische Prozesse und Krankheiten zu gewinnen.

  • Grundlagen der Genomik und Proteomik
  • Sequenzierungstechniken und Datenextraktion
  • ML-Modelle zur Genomanalyse und -vorhersage
  • Analyse von Proteomik-Daten mit ML
  • Integration genetischer und proteomischer Daten für systembiologische Studien
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Alles Wichtige zu diesem Kurs an der Universität Erlangen-Nürnberg

Maschinelles Lernen in der klinischen Bioinformatik an der Universität Erlangen-Nürnberg - Überblick

Der Kurs 'Maschinelles Lernen in der klinischen Bioinformatik' an der Universität Erlangen-Nürnberg bietet Dir eine umfassende Einführung in die Anwendung von Machine Learning-Algorithmen im Bereich der Bioinformatik. Hier lernst Du, wie solche Algorithmen in klinischen Studien eingesetzt und ausgewertet werden können. Im Kurs kombinierst Du theoretisches Wissen mit praktischen Übungen, was Dir ein tiefes Verständnis für die Themenfelder der Genomik und Proteomik sowie den Einsatz neuronaler Netze und Deep Learning in der klinischen Bioinformatik vermittelt. Diese Lehrveranstaltung ist speziell für Studierende der Informatik konzipiert und findet im Wintersemester statt.

Wichtige Informationen zur Kursorganisation

Kursleiter: Prof. Dr.

Modulstruktur: Vorlesung und Übungen mit einem Gesamtumfang von 5 ECTS. Die Veranstaltung besteht aus wöchentlichen Vorlesungen (2 SWS) und begleitenden Übungen (2 SWS).

Studienleistungen: Am Ende des Semesters wird eine schriftliche Prüfung abgehalten. Zusätzlich gibt es regelmäßige Übungsblätter, die zur Vorbereitung auf die Prüfung dienen.

Angebotstermine: Die Lehrveranstaltung wird im Wintersemester angeboten.

Curriculum-Highlights: Überblick über Maschinelles Lernen, Anwendung von Machine Learning-Algorithmen in der Bioinformatik, Klinische Studien und deren Auswertung, Neuronale Netze und Deep Learning, Genomik und Proteomik

So bereitest Du Dich optimal auf die Prüfung vor

Beginne frühzeitig mit dem Lernen, idealerweise schon zu Beginn des Semesters, um Dir die nötige theoretische Basis anzueignen.

Nutze verschiedene Ressourcen, wie Bücher, Übungsaufgaben, Karteikarten und Probeklausuren, um dein Wissen zu vertiefen.

Schließe Dich Lerngruppen an und tausche Dich mit anderen Studierenden aus, um gemeinsam Lösungsstrategien zu entwickeln.

Vergiss nicht, regelmäßige Pausen einzulegen und in diesen Zeiten komplett abzuschalten, um eine Überbelastung zu vermeiden.

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